RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0U1RQV5 110 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 CENPXA8MT69 81 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 KRT33AO76009 404 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ARSBP15848 533 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 BTCP35070 178 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ECH1Q13011 328 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 MTFR2Q6P444 385 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PLXDC2Q6UX71 529 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 OR52I2Q8NH67 350 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 FCAMRQ8WWV6 532 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 EXO5Q9H790 373 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 E9PLN8 166 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ORC5O43913 435 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CRYGSP22914 178 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CAPZA1P52907 286 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DYRK1AQ13627 763 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 C3AR1Q16581 482 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PLA1AQ53H76 456 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 NAA40Q86UY6 237 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 TUSC5Q8IXB3 177 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR13C9Q8NGT0 318 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SLC7A6Q92536 515 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 UPRTQ96BW1 309 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 MARVELD1Q9BSK0 173 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DIABLOQ9NR28 239 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 KLK13Q9UKR3 277 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 GGT3PA6NGU5 568 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SYNGR3O43761 229 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 TPTEP56180 551 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 STK11Q15831 433 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 GFOD2Q3B7J2 385 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 NRN1LQ496H8 165 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PGAP1Q75T13 922 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SPTBN2O15020 2390 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf63A6NC05 138 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 LDLRAD4O15165 306 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ABOP16442 354 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF32P17041 273 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PCBD1P61457 104 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP1BQ7LBR1 199 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 BIVMQ86UB2 503 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR52N4Q8NGI2 321 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR14K1Q8NGZ2 314 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR1F12Q8NHA8 337 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 UQCC2Q9BRT2 126 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CALHM2Q9HA72 323 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 AKAP13Q12802 2813 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC13O75165 2243 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0B4J293 547 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CIB4A0PJX0 185 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR6C65A6NJZ3 312 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DBHP09172 617 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CPN1P15169 458 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 FOXC1Q12948 553 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF774Q6NX45 483 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR4D6Q8NGJ1 314 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CREB3L1Q96BA8 519 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 LYZL4Q96KX0 146 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SPRR3Q9UBC9 169 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 GABRA1P14867 456 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DRAM2Q6UX65 266 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SLC16A14Q7RTX9 510 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PTX4Q96A99 478 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 WDYHV1Q96HA8 205 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CNTD2Q9H8S5 307 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SLC7A10Q9NS82 523 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR6C6A6NF89 314 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ECDO95905 644 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-9P01782 118 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SPINK2P20155 84 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PHF21AQ96BD5 680 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 ZFHX4Q86UP3 3567 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 FARS2O95363 451 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 YES1P07947 543 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 AP3S2P59780 193 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 PMP22Q01453 160 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZSR3 168 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 SKA3Q8IX90 412 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR5AS1Q8N127 324 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC54Q8NEL0 328 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 OR2H1Q9GZK4 316 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 DPAGT1Q9H3H5 408 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 V9GYS6 101 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 KDM4BO94953 1096 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC2P0DI81 140 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms