RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 EFNA3P52797 238 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 SLC26A5P58743 744 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 FZD2Q14332 565 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 HOGA1Q86XE5 327 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF721Q8TF20 911 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 PTX4Q96A99 478 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 TCTN2Q96GX1 697 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 ARL5BQ96KC2 179 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 ZFP57Q9NU63 452 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ZNF3-202ENST00000299667 A0A0A6YYD4 124 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MS4A18H0YCH9 400 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NPIPB7O75200 414 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TTRP02766 147 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SERPINA5P05154 406 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ISG15P05161 165 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ABOP16442 354 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 BCKDHBP21953 392 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NME2P22392 152 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 QRFPP83859 136 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 AVPI1Q5T686 147 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TERB2Q8NHR7 220 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TMEM230Q96A57 120 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 OR10C1Q96KK4 312 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RHOFQ9HBH0 211 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MMP26Q9NRE1 261 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 LRP3O75074 770 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 IGKV3-11P04433 115 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 IGHV4-34P06331 123 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 HOXB5P09067 269 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 CBR1P16152 277 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RABIFP47224 123 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MEOX2P50222 304 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 S100A10P60903 97 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RAB32Q13637 225 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 COMMD2Q86X83 199 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 CRB3Q9BUF7 120 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NMES1Q9C002 83 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RTTNQ86VV8 2226 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 BLACEA4D250 179 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 ALG1L2C9J202 215 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 C9JQL5 133 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 TSPAN2O60636 221 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 FBXO24O75426 580 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 RAD51DO75771 328 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 OPN1LWP04000 364 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 GABRG2P18507 467 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 GLRA1P23415 457 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 MPZP25189 248 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 HSD11B1P28845 292 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 LPAR6P43657 344 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF3-202ENST00000299667 CX3CR1P49238 355 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms