RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GLRX2Q9NS18 164 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ACOD1A6NK06 481 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAF1P04049 648 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 IL7P13232 177 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LAP3P28838 519 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PSMD7P51665 324 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 BAK1Q16611 211 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FCRLAQ7L513 359 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR8H2Q8N162 312 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SETD6Q8TBK2 473 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MBD6Q96DN6 1003 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LRP12Q9Y561 859 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF726A6NNF4 738 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GPR171O14626 319 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM127O75204 238 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DEFA1P59665 94 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DEFA3P59666 94 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GPR148Q8TDV2 347 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 THRSPQ92748 146 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PDCD5O14737 125 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMCC2O75069 709 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PNPP00491 289 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NR2C1P13056 603 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ATF1P18846 271 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ELK1P19419 428 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MAGEB1P43366 347 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CLDN17P56750 224 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAC3P60763 192 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KCNMB1Q16558 191 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR7E24Q6IFN5 339 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF544Q6NX49 715 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SYT9Q86SS6 491 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MCHR2Q969V1 340 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GFI1Q99684 422 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMUB1Q9BVT8 246 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TIGARQ9NQ88 270 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.15■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PFDN1O60925 122 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TSC22D1Q15714 1073 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SPATC1Q76KD6 591 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 R4GMQ9 66 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DSCAMO60469 2012 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FUOMA2VDF0 154 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CSF3P09919 207 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 NPR2P20594 1047 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PYDC2Q56P42 97 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CARD17Q5XLA6 110 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM54Q969K7 222 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ORAI1Q96D31 301 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR2M2Q96R28 347 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ARID1AO14497 2285 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PPL8 197 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PQ09 198 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PAHP00439 452 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-DQB1P01920 261 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 QDPRP09417 244 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DCTDP32321 178 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 BCAP31P51572 246 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXC6-201ENST00000243108 P2RY14Q15391 338 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms