RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	STUM	Q69YW2	141 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5S	Q99766	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PP18	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SIRPB1	O00241	398 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PI15	O43692	258 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HP	P00738	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSL	P07711	333 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NR2C1	P13056	603 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TDGF1	P13385	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF30	P17039	623 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRG2	P18507	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PCYT1A	P49585	367 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CST6	Q15828	149 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF2	Q99496	336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		Q9H521	79 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NGF	P01138	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNW1	P05000	195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDOB	P05062	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-E	P13747	358 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ADRB3	P13945	408 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PMCH	P20382	165 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	EDNRA	P25101	427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMB6	P28072	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR183	P32249	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DRD3	P35462	400 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RY2	P41231	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DIO3	P55073	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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