RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616122.4

SYNCRIP-204, Transcript of synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNCRIP, Length 6,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIP-204ENST00000616122 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 LANCL2Q9NS86 450 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PISDQ9UG56 409 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 STMND1H3BQB6 276 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MBTPS2O43462 519 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 DDAH2O95865 285 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 BCKDHBP21953 392 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ITGA3P26006 1051 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 NPY4RP50391 375 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 EPHA4P54764 986 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SCAND1P57086 179 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PIGTQ969N2 578 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SPTSSAQ969W0 71 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 WDPCPO95876 746 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TXNDC12O95881 172 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR4E1P0C645 316 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 UBBP0CG47 229 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 CASRP41180 1078 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 EGR4Q05215 589 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 DHRS2Q13268 280 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 EHFQ9NZC4 300 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SIP14410 1827 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 A0A1W2PR77 199 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 AGPAT2O15120 278 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 S100A6P06703 90 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PPP3CBP16298 524 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ABOP16442 354 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TAS2R31P59538 309 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 CLLU1Q5K131 121 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 LYPD8Q6UX82 237 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 NUBPLQ8TB37 319 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SEH1LQ96EE3 360 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 GNRHR2Q96P88 292 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 WNT16Q9UBV4 365 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MGAMO43451 1857 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TPOP07202 933 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 GUSBP08236 651 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PET100P0DJ07 73 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TCN2P20062 427 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SERPINA2P20848 420 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 THBS2P35442 1172 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PLAURQ03405 335 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RSU1Q15404 277 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TERB2Q8NHR7 220 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 MAP6Q96JE9 813 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SOSTQ9BQB4 213 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SYT3Q9BQG1 590 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ADAM19Q9H013 955 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PTPRDP23468 1912 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TSC2P49815 1807 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR5H14A6NHG9 310 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 M0R135 149 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 FBXO24O75426 580 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 TPPPO94811 219 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ARL3P36405 182 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 EFNB2P52799 333 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 LIMK1P53667 647 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 ROM1Q03395 351 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.05□□□□□ -1.6
SYNCRIP-204ENST00000616122 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.05□□□□□ -1.6
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