RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC35E1Q96K37 410 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 COA4Q9NYJ1 87 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 COL4A1P02462 1669 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 A0A1B0GWA3 101 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ID1P41134 155 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CLDN17P56750 224 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 MSMO1Q15800 293 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TEX261Q6UWH6 196 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 PGAP1Q75T13 922 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR52N1Q8NH53 320 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 NMNAT3Q96T66 252 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 PROCRQ9UNN8 238 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM72A0PK05 275 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 J3QR89 54 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CTNSO60931 367 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OLFM2O95897 454 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SELENOTP62341 195 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMUB2Q71RG4 321 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RNF128Q8TEB7 428 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR8B4Q96RC9 309 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACOD1A6NK06 481 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RNF212BA8MTL3 300 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SSR4P51571 173 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CLDN12P56749 244 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 Q499Y3 187 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF626Q68DY1 528 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ELP2Q6IA86 826 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZFP92A6NM28 416 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 HCRTR1O43613 425 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 IGHEP01854 428 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SBK3P0C264 359 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR13C7P0DN81 318 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 DPTQ07507 201 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RTL8BQ17RB0 113 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 Q3ZCU0 254 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TDHQ8IZJ6 230 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 NEURL2Q9BR09 285 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 NICN1Q9BSH3 213 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.63□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 DOCK2Q92608 1830 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMPRSS11DO60235 418 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 UBL3O95164 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR4E1P0C645 316 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 HTR1FP30939 366 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 FOXK2Q01167 660 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 EXT1Q16394 746 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 KDM8Q8N371 416 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM101Q96IK0 257 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RCE1Q9Y256 329 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPTA1P02549 2419 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 VEGFCP49767 419 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 LIM2P55344 173 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 KIAA1024LP59773 190 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR5R1Q8NH85 324 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 CCL17Q92583 94 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 GHSRQ92847 366 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 LHX6Q9UPM6 363 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRIP11Q15643 1979 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 A0A1W2PR48 441 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF749O43361 778 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ETHE1O95571 254 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR5AL1P0C617 328 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 LTBQ06643 244 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 OXA1LQ15070 435 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACKR1Q16570 336 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 Q6ZNB5 142 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.62□□□□□ -1.03
SRGAP2B-204ENST00000612199 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.62□□□□□ -1.03
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