RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611462.1

TRBV10-3-201, Transcript of T cell receptor beta variable 10-3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV10-3, Length 368 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3-201ENST00000611462 SFTPCP11686 197 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CD79AP11912 226 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 FSTP19883 344 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CCL1P22362 96 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 TIMP3P35625 211 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 OR10A3P58181 314 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 RBPJQ06330 500 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 GFRALQ6UXV0 394 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 Q6ZT83 130 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CCDC190Q86UF4 302 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CD163Q86VB7 1156 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 COMMD2Q86X83 199 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 MFSD4AQ8N468 514 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 FGGYQ96C11 551 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CMTM3Q96MX0 182 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 GPR84Q9NQS5 396 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 CACNA1CQ13936 2221 aa7.47□□□□□ -1.21
TRBV10-3-201ENST00000611462 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 CIB4A0PJX0 185 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FABP12A6NFH5 140 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 IFITM5A6NNB3 132 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 H3BSH0 61 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 TBX1O43435 398 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 IL18BPO95998 194 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 IGLV3-1P01715 115 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 HLA-HP01893 362 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 LCATP04180 440 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 MAS1P04201 325 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ITGA5P08648 1049 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 DBHP09172 617 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ZNF20P17024 532 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 THBS2P35442 1172 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 GNALP38405 381 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 TDGF1P3P51864 188 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 RAB1AP62820 205 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 KLRB1Q12918 225 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 P2RY6Q15077 328 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 RTL6Q6ICC9 239 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 PGAP1Q75T13 922 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 NAA40Q86UY6 237 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 LAX1Q8IWV1 398 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SLC7A6Q92536 515 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ITFG2Q969R8 447 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SGK3Q96BR1 496 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 C10orf35Q96D05 121 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ORAI1Q96D31 301 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 STARD4Q96DR4 205 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 BOD1Q96IK1 185 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 RGCCQ9H4X1 137 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.46□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FAM25AB3EWG3 89 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FAM25CB3EWG5 89 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 FAM25GB3EWG6 89 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 J3QRK9 145 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 HPGDSO60760 199 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 TNFSF13O75888 250 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 CGAP01215 116 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 CALCBP10092 127 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 CD37P11049 281 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ADRA2CP18825 462 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBV10-3-201ENST00000611462 ATF1P18846 271 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms