RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567306.5

PDXDC1-215, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-215ENST00000567306 CAV3P56539 151 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 RELBQ01201 579 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GALK2Q01415 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 MXD1Q05195 221 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 PMPCAQ10713 525 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GABRA6Q16445 453 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 Q499Y3 187 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ZNF544Q6NX49 715 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 FAM57BQ71RH2 274 aa6.5□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 MDP1Q86V88 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SOX7Q9BT81 388 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 WACQ9BTA9 647 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 RNF121Q9H920 327 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 NOX4Q9NPH5 578 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A0G2JK05 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A1B0GTI1 187 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 UBL3O95164 117 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GPR148Q8TDV2 347 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 LYZL4Q96KX0 146 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ZNF75AQ96N20 296 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDXDC1-215ENST00000567306 TSC22D3Q99576 134 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GFI1Q99684 422 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 MED18Q9BUE0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GPR84Q9NQS5 396 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 DHDHQ9UQ10 334 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.49□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SVILO95425 2214 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A1B0GVI7 797 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 CIB4A0PJX0 185 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 CASKO14936 926 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 TBX1O43435 398 aa6.48□□□□□ -1.37
PDXDC1-215ENST00000567306 SYT7O43581 403 aa6.48□□□□□ -1.37
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