RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567040.5

PPP4C-210, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 879 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-210ENST00000567040 HIST1H3AP68431 136 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 MALLQ13021 153 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.66□□□□□ -0.06
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PPP4C-210ENST00000567040 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 OR8B2Q96RD0 313 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 MED4Q9NPJ6 270 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 MIOXQ9UGB7 285 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.66□□□□□ -0.06
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PPP4C-210ENST00000567040 ZNF823P16415 610 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 PRTN3P24158 256 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 PITPNBP48739 271 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 MXRA7P84157 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 OR8G1Q15617 311 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 PGAP1Q75T13 922 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.65□□□□□ -0.06
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PPP4C-210ENST00000567040 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 CDRT15Q96T59 188 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-210ENST00000567040 IFNL4K9M1U5 179 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 SEMG1P04279 462 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 HKR1P10072 659 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 CA6P23280 308 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 OMGP23515 440 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 PRDX6P30041 224 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 GGT2P36268 569 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 RAD23AP54725 363 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 TPTEP56180 551 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 PAX8Q06710 450 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 FOXL1Q12952 345 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 MPPED2Q15777 294 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 ZNF404Q494X3 552 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.64□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.64□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.64□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 WIPF1O43516 503 aa14.63□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.63□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 SLC25A28Q96A46 364 aa14.63□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 ZNF799Q96GE5 643 aa14.63□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.63□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 C3orf80F5H4A9 247 aa14.62□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 SLC2A1P11166 492 aa14.62□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 GSSP48637 474 aa14.62□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 PRKXP51817 358 aa14.62□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 FGF12P61328 243 aa14.62□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 TAF13Q15543 124 aa14.62□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.62□□□□□ -0.07
PPP4C-210ENST00000567040 OR8B8Q15620 311 aa14.62□□□□□ -0.07
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PPP4C-210ENST00000567040 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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