RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.06■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ZNF799Q96GE5 643 aa16.06■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.06■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 EBAG9O00559 213 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CRLF1O75462 422 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 TEX30Q5JUR7 227 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 FAM166AQ6J272 317 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CLDN25C9JDP6 229 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ADH4P08319 380 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SLC2A1P11166 492 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PCK2Q16822 640 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ST7LQ8TDW4 575 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 HPS1Q92902 700 aa16.04■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ZNF878C9JN71 531 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SELENOFO60613 162 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 LMX1BO60663 402 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CD55P08174 381 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ESRRGP62508 458 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 APOFQ13790 326 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PGAP1Q75T13 922 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SHFQ7M4L6 423 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PARP8Q8N3A8 854 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OR8G5Q8NG78 346 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ITLN1Q8WWA0 313 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 RAB1CQ92928 201 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 TIMD4Q96H15 378 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 KCNJ15Q99712 375 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ABHD6Q9BV23 337 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.03■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 ISPDA4D126 451 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 C5orf63A6NC05 138 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 H0YL77 283 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 M0R129 80 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 PRODHO43272 600 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SELEP16581 610 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 HSD11B1P28845 292 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SLC15A1P46059 708 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 DRAM2Q6UX65 266 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 TIGD4Q8IY51 512 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 THEM6Q8WUY1 208 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OR2V2Q96R30 315 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 AMELYQ99218 206 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 MARCH7Q9H992 704 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.02■□□□□ 0.16
USP10-208ENST00000563386 JMJD1CQ15652 2540 aa16.02■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.02■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 IQCF6A8MYZ5 107 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 TBX1O43435 398 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 TNFRSF1AP19438 455 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 ANOS1P23352 680 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 IGFBP5P24593 272 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 EPHA2P29317 976 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 CX3CR1P49238 355 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 ACTR3P61158 418 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 ZNF92Q03936 586 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 BEX2Q9BXY8 128 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 BRD7Q9NPI1 651 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 TMEM100Q9NV29 134 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.01■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 GGT3PA6NGU5 568 aa16■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 F5H5P2 479 aa16■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 PRKYO43930 277 aa16■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 HLA-DPB1P04440 258 aa16■□□□□ 0.15
USP10-208ENST00000563386 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms