RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556251.1

RAD51B-223, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 4

Gene RAD51B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-223	ENST00000556251	ENTPD5	O75356	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TIPRL	O75663	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PTH	P01270	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IGF2	P01344	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CST2	P09228	141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SPARC	P09486	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC2A1	P11166	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PAX1	P15863	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF823	P16415	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FPR3	P25089	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SELENOV	P59797	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PPP1CB	P62140	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CBX1	P83916	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	EFNB3	Q15768	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	USP51	Q70EK9	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CR1	P17927	2039 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TMCC2	O75069	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FKBP6	O75344	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TGFA	P01135	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TF	P02787	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PSKH1	P11801	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC25A16	P16260	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SELE	P16581	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ANOS1	P23352	680 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TNFSF4	P23510	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PAX7	P23759	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CRABP1	P29762	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RAD52	P43351	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NR4A2	P43354	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PPOX	P50336	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF81	P51508	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PRKX	P51817	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DSCR9	P59020	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RAP2B	P61225	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PCBD1	P61457	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CRMP1	Q14194	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TAF13	Q15543	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF124	Q15973	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MICA	Q29983	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms