RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 MUL1Q969V5 352 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SMIM19Q96E16 107 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C4orf45Q96LM5 186 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 AMELYQ99218 206 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FAM206AQ9NX38 181 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LCATP04180 440 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 HLA-DPB1P04440 258 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CD2P06729 351 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CECR9P0C854 216 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SMIM18P0DKX4 95 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PSKH1P11801 424 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF35P13682 527 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CELP19835 753 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CCNOP22674 350 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PSMB9P28065 219 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CCKARP32238 428 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 RANBP1P43487 201 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MAP2K4P45985 399 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PRKXP51817 358 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MOGQ16653 247 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GPR141Q7Z602 305 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SGCDQ92629 289 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 C10orf35Q96D05 121 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PGAM5Q96HS1 289 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR5M11Q96RB7 305 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 BATF3Q9NR55 127 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 HHLA2Q9UM44 414 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GVI7 797 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PR80 420 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 M0R1B8 84 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PSMD9O00233 223 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GPR37O15354 613 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ATE1O95260 518 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TFAP2AP05549 437 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LCKP06239 509 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CD3EP07766 207 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SELEP16581 610 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ACHEP22303 614 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NR4A1P22736 598 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CD40P25942 277 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GABRA5P31644 462 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DDOSTP39656 456 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ALDH3B2P48448 385 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF83P51522 516 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 UCP2P55851 309 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SELENOVP59797 346 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TUBA1BP68363 451 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NAAAQ02083 359 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 BLMHQ13867 455 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OTPQ5XKR4 325 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TUBA1AQ71U36 451 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DOK3Q7L591 496 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NUP37Q8NFH4 326 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GPR148Q8TDV2 347 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NEK6Q9HC98 313 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ABCB9Q9NP78 766 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms