RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 GJC3Q8NFK1 279 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 LINC01006Q8NI28 216 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SLC7A6Q92536 515 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 Q96M85 177 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 BATF3Q9NR55 127 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.07□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 F5H5P2 479 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 PHYHO14832 338 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 NDUFB2O95178 105 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 PLATP00750 562 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 CTLA4P16410 223 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FPR3P25089 353 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 CRABP1P29762 137 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 GPR4P46093 362 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 NPY4RP50391 375 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FGF12P61328 243 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ZNF404Q494X3 552 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 IFI44LQ53G44 452 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ADCK1Q86TW2 530 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ERGIC1Q969X5 290 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TECTBQ96PL2 329 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 COQ7Q99807 217 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SYT4Q9H2B2 425 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 AURKCQ9UQB9 309 aa7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 A0A087WUU8 490 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 H0YL77 283 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 J3KTA2 159 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 P2RY10O00398 339 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SOCS2O14508 198 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 RER1O15258 196 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FSTL3O95633 263 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 LIPFP07098 398 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 DBHP09172 617 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SDHAP31040 664 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ERFP50548 548 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 RPS6KA3P51812 740 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 PAX2Q02962 417 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ECH1Q13011 328 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 KLF10Q13118 480 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 KRT72Q14CN4 511 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OR8G1Q15617 311 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SLC36A3Q495N2 470 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 MESTQ5EB52 335 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 ASRGL1Q7L266 308 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 FITM2Q8N6M3 262 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 SGCDQ92629 289 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 DYRK2Q92630 601 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 NSL1Q96IY1 281 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.05□□□□□ -1.28
TROAP-208ENST00000548817 TRIM15Q9C019 465 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms