RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534626.6

RECQL4-208, Transcript of RecQ like helicase 4, human

TSL 5

Gene RECQL4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RECQL4-208	ENST00000534626	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626		F5H5K5	113 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	ARPC3	O15145	178 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	IDH3B	O43837	385 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GADD45G	O95257	159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GPANK1	O95872	356 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	PLAT	P00750	562 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	LCAT	P04180	440 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	TPTE	P56180	551 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	BPIFB3	P59826	476 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SPIB	Q01892	262 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	PAX2	Q02962	417 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SEC23B	Q15437	767 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	RFX4	Q33E94	735 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	WDR76	Q9H967	626 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	DCTN6	O00399	190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	DIRAS1	O95057	198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	CD200	P41217	278 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	NPY4R	P50391	375 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR8G1	Q15617	311 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626		Q8TCH9	128 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR10H3	O60404	316 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	CRYBA1	P05813	215 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	ZNF823	P16415	610 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GGT2	P36268	569 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626		V9GYQ6	96 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL4-208	ENST00000534626		A0A1B0GUS0	222 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626		M0R135	149 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FAM20B	O75063	409 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	PRDX6	P30041	224 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FGF12	P61328	243 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	PYURF	Q96I23	114 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	GMDS	O60547	372 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	FABP3	P05413	133 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	LIPF	P07098	398 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	PMEL	P40967	661 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RECQL4-208	ENST00000534626	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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