RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533252.1

CASP4-211, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 3

Gene CASP4, Length 215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-211ENST00000533252 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ACER3Q9NUN7 267 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 EMCNQ9ULC0 261 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IFT52Q9Y366 437 aa4.1□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 BSNQ9UPA5 3926 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 A0A096LPI6 279 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 A0A0J9YW62 118 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CFAP73A6NFT4 308 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MSGN1A6NI15 193 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 EVPLLA8MZ36 301 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 H0YC42 278 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RFXANKO14593 260 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MLNRO43193 412 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 AQP8O94778 261 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 VAMP5O95183 116 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PSMG1O95456 288 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CGAP01215 116 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GUSBP08236 651 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CFC1BP0CG36 223 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CFC1P0CG37 223 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR12D1P0DN82 309 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IDO1P14902 403 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PPIBP23284 216 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 AGTR1P30556 359 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IFNA8P32881 189 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CRATP43155 626 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FABP6P51161 128 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CRISP3P54108 245 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PRPS1P60891 318 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 NCALDP61601 193 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF117Q03924 483 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PDK3Q15120 406 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF141Q15928 474 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 KLHL22Q53GT1 634 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GRINAQ7Z429 371 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TCEANCQ8N8B7 351 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RNF138Q8WVD3 245 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TESCQ96BS2 214 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 S100PBPQ96BU1 408 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ROPN1LQ96C74 230 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ITCHQ96J02 903 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FCRL1Q96LA6 429 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR51I1Q9H343 314 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TMEM181Q9P2C4 612 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 BTNL2Q9UIR0 455 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GPR132Q9UNW8 380 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.09□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 C9JVG2 144 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 E9PBE3 544 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 UBDO15205 165 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 HDAC3O15379 428 aa4.08□□□□□ -1.76
CASP4-211ENST00000533252 ZNF208O43345 1280 aa4.08□□□□□ -1.76
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