RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531842.1

USF1-210, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene USF1, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-210ENST00000531842 OPN1MWP04001 364 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TSPAN19P0C672 248 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GSK3BP49841 420 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 LOXL3P58215 753 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GNGT1P63211 74 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 COX10Q12887 443 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MAB21L1Q13394 359 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MAPRE2Q15555 327 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RRM2BQ7LG56 351 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NRMQ8IXM6 262 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TMEM86BQ8N661 226 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR2T12Q8NG77 320 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.39□□□□□ -1.23
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USF1-210ENST00000531842 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PPA2Q9H2U2 334 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RERGLQ9H628 205 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 C16orf95Q9H693 158 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MRGBPQ9NV56 204 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GID8Q9NWU2 228 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 C5orf63A6NC05 138 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 P2RY10O00398 339 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GSTA4O15217 222 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SGCEO43556 437 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR10H3O60404 316 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF682O95780 498 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TFF1P04155 84 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 IFNW1P05000 195 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NCK1P16333 377 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PSMB10P40306 273 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PSME3P61289 254 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SELENOWP63302 87 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TRAM2Q15035 370 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CBLL1Q75N03 491 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SYT9Q86SS6 491 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR8G5Q8NG78 346 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 C17orf50Q8WW18 174 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SGCDQ92629 289 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PTP4A1Q93096 173 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PRRC1Q96M27 445 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 POLE4Q9NR33 117 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MEGF11A6BM72 1044 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CXCR6O00574 342 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PHYHO14832 338 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RER1O15258 196 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ADAM20O43506 726 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MPIG6BO95866 241 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GYPAP02724 150 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SEMG1P04279 462 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 COX5BP10606 129 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TUBG1P23258 451 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PRDX6P30041 224 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SLC9A3P48764 834 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CENPAP49450 140 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NUDT2P50583 147 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PRKCDQ05655 676 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 LY6EQ16553 131 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MEP1BQ16820 701 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NAA40Q86UY6 237 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RNF148Q8N7C7 305 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.37□□□□□ -1.23
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