RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 BEX2Q9BXY8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZBP1Q9H171 429 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR51I1Q9H343 314 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GHITMQ9H3K2 345 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C12orf10Q9HB07 376 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IL20Q9NYY1 176 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CALML5Q9NZT1 146 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IL36AQ9UHA7 158 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GPR34Q9UPC5 381 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DOCK6Q96HP0 2047 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CTDSPLO15194 276 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LRRTM2O43300 516 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RNF13O43567 381 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PTP4A3O75365 173 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A5O76082 557 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FGF19O95750 216 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPN2P04844 631 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HMGN1P05114 100 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SERPIND1P05546 499 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NR2F1P10589 423 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ALPPL2P10696 532 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANXA3P12429 323 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 STOMP27105 288 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TEAD1P28347 426 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CCR8P51685 355 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CAV3P56539 151 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CSNK1G2P78368 415 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NDPQ00604 133 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HSF2Q03933 536 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ST3GAL3Q11203 375 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 BAMBIQ13145 260 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IL18Q14116 193 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZIC1Q15915 447 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CLLU1Q5K131 121 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NIPAL3Q6P499 406 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ADCK2Q7Z695 626 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TPRA1Q86W33 373 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM25Q86YD3 366 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GANCQ8TET4 914 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RAB8BQ92930 207 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 YIPF5Q969M3 257 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM203Q969S6 136 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RADILQ96JH8 1075 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TEX12Q9BXU0 123 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AICDAQ9GZX7 198 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ABCG4Q9H172 646 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 COPZ2Q9P299 210 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IL17BQ9UHF5 180 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SATB2Q9UPW6 733 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HSPB11Q9Y547 144 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CACNG2Q9Y698 323 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PCM1Q15154 2024 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DENND4CQ5VZ89 1909 aa3.53□□□□□ -1.84
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