RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	TNK1	Q13470	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MELK	Q14680	651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB11B	Q15907	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PCK2	Q16822	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MED30	Q96HR3	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GFI1	Q99684	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MED11	Q9P086	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FLNC	Q14315	2725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0B4J203	849 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1B0GUH1	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PQ72	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM221A	A4D161	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PEX14	O75381	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2J2	O76002	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SCGN	O76038	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	VAMP5	O95183	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TGM6	O95932	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHG1	P01857	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PF4	P02776	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD37	P11049	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ICAM2	P13598	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ADRA2C	P18825	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	C4BPB	P20851	252 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CDK2	P24941	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LAP3	P28838	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BTC	P35070	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PTGDS	P41222	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PTH2R	P49190	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BID	P55957	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PER3	P56645	1201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLRN1	P58418	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACTB	P60709	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACTG1	P63261	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35A1	P78382	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFITM2	Q01629	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	1e-6	■■■■□ 22.4
NPIPB4-205	ENST00000520808	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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