RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 GDF1P27539 372 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 LHX2P50458 406 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKXP51817 358 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1J2Q8NGS2 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 HES7Q9BYE0 225 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 CENPXA8MT69 81 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 SYT7O43581 403 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G2AP14555 144 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 CX3CR1P49238 355 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF84P51523 738 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RAG2P55895 527 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPOCK1Q08629 439 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MTFR2Q6P444 385 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT74Q7RTS7 529 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM45BQ96B21 275 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 NCKAP5O14513 1909 aa9.48□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 CELA3AP09093 270 aa9.48□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 NME2P22392 152 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPZA1P52907 286 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 QRFPP83859 136 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL2A1Q16548 175 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.48□□□□□ -0.89
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SH3BP2-209ENST00000504450 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.48□□□□□ -0.89
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