RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GABRA6Q16445 453 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00167Q96N53 147 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PALLDQ8WX93 1383 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 GABRPO00591 440 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MBP02144 154 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 GLAP06280 429 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CRYGCP07315 174 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC3P17980 439 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PMCHP20382 165 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PPOXP50336 477 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB8P50452 374 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 AP1S2P56377 157 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ESRRGP62508 458 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 LCN2P80188 198 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC63Q05C16 580 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 STK38Q15208 465 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 COQ8AQ8NI60 647 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 IFNKQ9P0W0 207 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF222Q9UK12 451 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 KIF27Q86VH2 1401 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YYE9 177 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPV4 95 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A20A6NK97 555 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MPDU1O75352 247 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TRBC1P01850 177 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PGA5P0DJD9 388 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN6P56747 220 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SNX20Q7Z614 316 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CALHM1Q8IU99 346 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM104Q8NE00 496 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G6Q8NH81 332 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 FAM104AQ969W3 186 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RCN3Q96D15 328 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF382Q96SR6 550 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YXV3 536 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CENPXA8MT69 81 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CPN2P22792 545 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 GABRR2P28476 465 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A6Q13433 755 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 MLIPQ5VWP3 458 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PTX4Q96A99 478 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS1Q96CS2 278 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PSG11Q9UQ72 335 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUH1 482 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 YIF1AO95070 293 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PGA4P0DJD7 388 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PGA3P0DJD8 388 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 HTR1DP28221 377 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 BMI1P35226 326 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SGTBQ96EQ0 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 AGMATQ9BSE5 352 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR2AG1Q9H205 316 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf10Q9HB07 376 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ADA2Q9NZK5 511 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CTDNEP1O95476 244 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 STAG3L2P0CL84 134 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PPICP45877 212 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 KDSRQ06136 332 aa4.81□□□□□ -1.64
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