RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 ISPDA4D126 451 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CLDN25C9JDP6 229 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 F5H5K5 113 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TNFRSF11BO00300 401 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ARPC3O15145 178 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MLNRO43193 412 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV2-70P01814 119 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 HLA-DPB1P04440 258 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CLUP10909 449 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NR2C1P13056 603 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 EGR1P18146 543 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 HNF1AP20823 631 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 FPR3P25089 353 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC6A6P31641 620 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 GGT2P36268 569 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MXRA7P84157 204 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TSPAN31Q12999 210 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 AQP6Q13520 282 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM209AQ5JX71 171 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf89Q6UX73 402 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR51F2Q8NH61 342 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 FANK1Q8TC84 345 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB1CQ92928 201 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MAP6Q96JE9 813 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 WACQ9BTA9 647 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NPTNQ9Y639 398 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 F5H5P2 479 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 BHLHE40O14503 412 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SOX14O95416 240 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 RENP00797 406 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 MT-ND5P03915 603 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 LCATP04180 440 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 GYPBP06028 91 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ACSM4P0C7M7 580 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 RAC2P15153 192 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CRABP1P29762 137 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SMIM11AP58511 58 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 COX10Q12887 443 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 GJC3Q8NFK1 279 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2V2Q96R30 315 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 PITX2Q99697 317 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 COQ7Q99807 217 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 GAL3ST1Q99999 423 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 U3KQV3 271 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM178BH3BS89 294 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 H3BSA7 217 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TCF21O43680 179 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 DCTN3O75935 186 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CCNB2O95067 398 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 PNPP00491 289 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 HLA-DQA2P01906 255 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 WNT2P09544 360 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC2A1P11166 492 aa6.13□□□□□ -1.43
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