RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 SH3BGRLO75368 114 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GLCEO94923 617 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ITGA5P08648 1049 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ATF1P18846 271 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SMIM11AP58511 58 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RFKQ969G6 155 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CHST11Q9NPF2 352 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NINQ8N4C6 2090 aa6.86□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FAM186AA6NE01 2351 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PR64 198 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PRV1 198 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR2AT4A6NND4 320 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FAM157AC9JC47 383 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SULT2B1O00204 365 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NDUFS8O00217 210 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CD8AP01732 235 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC25A4P12235 298 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RAB5AP20339 215 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PPP2R1BP30154 601 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 BMI1P35226 326 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CDH11P55287 796 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MEF2DQ14814 521 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TBR1Q16650 682 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LINGO2Q7L985 606 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 C1QL4Q86Z23 238 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NUBPLQ8TB37 319 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LIPHQ8WWY8 451 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LMF1Q96S06 567 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TSTD3H0UI37 97 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 J3QRE1 110 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMPRSS11DO60235 418 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 DNAJB6O75190 326 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 DDAH2O95865 285 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SPINK2P20155 84 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CPT2P23786 658 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 S100A7P31151 101 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 APLNRP35414 380 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MC3RP41968 323 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RSU1Q15404 277 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 STOML3Q8TAV4 291 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF721Q8TF20 911 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SGCZQ96LD1 299 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RNF24Q9Y225 148 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RAXQ9Y2V3 346 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LAMA5O15230 3695 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MPZP25189 248 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 S100A2P29034 98 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GLP1RP43220 463 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR2B8PP59922 312 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 IRF8Q02556 426 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MESTQ5EB52 335 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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