RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 SGCDQ92629 289 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SPTSSAQ969W0 71 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 MBD6Q96DN6 1003 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 FAM206AQ9NX38 181 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RAB26Q9ULW5 256 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CMAHPQ9Y471 501 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 B9A039 149 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF254O75437 659 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LCKP06239 509 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 H2BFMP0C1H6 154 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 TUBG1P23258 451 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 HSPA13P48723 471 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CX3CR1P49238 355 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PRSS12P56730 875 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 TNK1Q13470 666 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CDONQ4KMG0 1287 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 GLYATL3Q5SZD4 288 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SPSB4Q96A44 273 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SGK3Q96BR1 496 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 HAVCR1Q96D42 359 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LYZL4Q96KX0 146 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SIGLEC11Q96RL6 698 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SYT3Q9BQG1 590 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.13□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 A0A1B0GWJ7 208 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SNTNA6NMZ2 147 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 H3BSA7 217 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PHYHO14832 338 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LILRA1O75019 489 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 FAM20BO75063 409 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 NDUFS7O75251 213 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SULT1C4O75897 302 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 IGLV3-1P01715 115 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LCATP04180 440 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KITLGP21583 273 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ETV1P50549 477 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 MMP15P51511 669 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 MMP16P51512 607 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 OR12D2P58182 307 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF92Q03936 586 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 TAF13Q15543 124 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SNCBQ16143 134 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KLHL22Q53GT1 634 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 AGAP6Q5VW22 663 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LIPNQ5VXI9 398 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ARL9Q6T311 187 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KRT77Q7Z794 578 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CDH24Q86UP0 819 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RORBQ92753 470 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CMBLQ96DG6 245 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SOX7Q9BT81 388 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 NIPAL2Q9H841 368 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 AKAP9Q99996 3911 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 METTL15A6NJ78 407 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ACOD1A6NK06 481 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 H7C417 338 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 SLC1A7O00341 560 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RAC2P15153 192 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ATP6V1E1P36543 226 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 CDKN1AP38936 164 aa11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ST3GAL4Q11206 333 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms