RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CDRT15Q96T59 188 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 FN3KQ9H479 309 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 TMEM165Q9HC07 324 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 ESM1Q9NQ30 184 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 ARPC2O15144 300 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 MLNRO43193 412 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 SNX3O60493 162 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 KRT36O76013 467 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 SEMG1P04279 462 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DPB1P04440 258 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 GGT2P36268 569 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 MTNR1AP48039 350 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 DOK3Q7L591 496 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 LINC00471Q8N535 108 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 ERGIC1Q969X5 290 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-212ENST00000484841 OR6C68A6NDL8 312 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 ATP8B1O43520 1251 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PRTN3P24158 256 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 GSSP48637 474 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 OR8G1Q15617 311 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 OR2T4Q8NH00 348 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A4Q9H015 551 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 M0R135 149 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 FSTL3O95633 263 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PITPNBP48739 271 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PAX8Q06710 450 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TAF13Q15543 124 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 KCNJ8Q15842 424 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 ZNF404Q494X3 552 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 NAA40Q86UY6 237 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PARP8Q8N3A8 854 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A28Q96A46 364 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 ZNF799Q96GE5 643 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DUX5Q96PT3 197 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CLN8Q9UBY8 286 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 GGT3PA6NGU5 568 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF11BO00300 401 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PPIAL4GP0DN37 164 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 HKR1P10072 659 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CD80P33681 288 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 GATA4P43694 442 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PRSS12P56730 875 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 SPATS1Q496A3 300 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CD300AQ9UGN4 299 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DCTN3O75935 186 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PYCR1P32322 319 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CD200P41217 278 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 TVP23AA6NH52 213 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 GMDSO60547 372 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 FAM20BO75063 409 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CCNB2O95067 398 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 SPARCP09486 303 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 CA6P23280 308 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 MNAT1P51948 309 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 MZT1Q08AG7 82 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 MAB21L1Q13394 359 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 FAM201AQ5SY85 155 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-212ENST00000484841 DRAM2Q6UX65 266 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms