RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	WBP2	Q969T9	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RAB7B	Q96AH8	199 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PCED1B	Q96HM7	432 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GINS4	Q9BRT9	223 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MYNN	Q9NPC7	610 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NIT2	Q9NQR4	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CIT	O14578	2027 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		A0A087WW49	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GSAP	A4D1B5	854 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C5orf52	A6NGY3	159 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		E7EQ34	232 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GOSR2	O14653	212 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF197	O14709	1029 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	FFAR1	O14842	300 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC31A2	O15432	143 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CLN5	O75503	358 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ARL6IP5	O75915	188 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZFAND5	O76080	213 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR2F2	O95006	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GUCA1C	O95843	209 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IGF2	P01344	180 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C1QC	P02747	245 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ATP1B1	P05026	303 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LGALS2	P05162	132 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CRYBA1	P05813	215 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IL3	P08700	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PIRT	P0C851	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR12D1	P0DN82	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	EPCAM	P16422	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ABO	P16442	354 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ADCYAP1	P18509	176 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CEL	P19835	753 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HOXA6	P31267	233 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CCR7	P32248	378 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SOAT1	P35610	550 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SPAM1	P38567	509 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PMEL	P40967	661 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RAB5C	P51148	216 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RAB28	P51157	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	P2RY4	P51582	365 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LBX1	P52954	281 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HCCS	P53701	268 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LIM2	P55344	173 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CLDN15	P56746	228 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR10A3	P58181	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RAB8A	P61006	207 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RAB2A	P61019	212 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CDK5	Q00535	292 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NFATC2	Q13469	925 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR2F1	Q13607	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PDE7A	Q13946	482 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GINS1	Q14691	196 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PON3	Q15166	354 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SSX2	Q16385	188 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SGCA	Q16586	387 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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