RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RNF121Q9H920 327 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 WDR76Q9H967 626 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MARCH7Q9H992 704 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZNF221Q9UK13 617 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SPATA2Q9UM82 520 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RASD1Q9Y272 281 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PPR1 153 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PRG6 482 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MEIOCA2RUB1 952 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 HMX3A6NHT5 357 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TMEM212A6NML5 194 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 VSTM5A8MXK1 200 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 LRRN3E7EW58 273 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 E9PI62 339 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CTDSPLO15194 276 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 LYRM1O43325 122 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ORC5O43913 435 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SELENOFO60613 162 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 AQP8O94778 261 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 IL18BPO95998 194 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 FOSL1P15407 271 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SPNP16150 400 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 IL11P20809 199 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 DNASE1P24855 282 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 HLA-DMAP28067 261 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 DDOSTP39656 456 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RFX2P48378 723 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CAV3P56539 151 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RAB25P57735 213 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 LTBQ06643 244 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZP4Q12836 540 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 Q499Y3 187 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MESTQ5EB52 335 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 XP32Q5T750 250 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 GGNQ86UU5 652 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TIGD4Q8IY51 512 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 POC1BQ8TC44 478 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 RFT1Q96AA3 541 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 DDIT4LQ96D03 193 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 INTS14Q96SY0 518 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 COPZ2Q9P299 210 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 COPS3Q9UNS2 423 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.51□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A0A0G2JK05 382 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A0A0J9YW62 118 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TMEM72A0PK05 275 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 FAM221AA4D161 298 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 PRSS37A4D1T9 235 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A8MXE2 369 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 AIPO00170 330 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TNFSF11O14788 317 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 PLA2G10O15496 165 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF9O43307 516 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SULT1B1O43704 296 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CXCL13O43927 109 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 FZD7O75084 574 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SLC43A1O75387 559 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SERPINI2O75830 405 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 NCR1O76036 304 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 F13BP05160 661 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CALCBP10092 127 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 ELK1P19419 428 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SRMP19623 302 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SFTPDP35247 375 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 THBS2P35442 1172 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 MMP15P51511 669 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CCR9P51686 369 aa5.5□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 AP3S2P59780 193 aa5.5□□□□□ -1.53
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