RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 PKP2Q99959 881 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ABHD6Q9BV23 337 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 NIPAL2Q9H841 368 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 CENPMQ9NSP4 180 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ABCA1O95477 2261 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ZANQ9Y493 2812 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 IFNL4K9M1U5 179 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 XRCC2O43543 280 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 LYNP07948 512 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 COL8A2P25067 703 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 HSD11B1P28845 292 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 RAD23AP54725 363 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 APOFQ13790 326 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 HFEQ30201 348 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 GID4Q8IVV7 300 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TMEM163Q8TC26 289 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 MNTQ99583 582 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TEAD3Q99594 435 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 SLC22A4Q9H015 551 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 IL19Q9UHD0 177 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 A0A1B0GWJ7 208 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 PSKH1P11801 424 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 OPRL1P41146 370 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 USP51Q70EK9 711 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 PGAP1Q75T13 922 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 YIPF5Q969M3 257 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 ITFG2Q969R8 447 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 MSL2Q9HCI7 577 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 S100A14Q9HCY8 104 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 C2CD3Q4AC94 2353 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYF2-203ENST00000474160 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CLDN25C9JDP6 229 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PRKYO43930 277 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LILRA1O75019 489 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ALPLP05186 524 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ALDH3A2P51648 485 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR2T2Q6IF00 324 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SPSB4Q96A44 273 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TIMD4Q96H15 378 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM160Q9NX00 188 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PHYHO14832 338 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SELENOFO60613 162 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 H2BFMP0C1H6 154 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LYNX1P0DP58 116 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ALOX5APP20292 161 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 EPHA2P29317 976 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 DDOSTP39656 456 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PRKXP51817 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CDC42P60953 191 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TMED1Q13445 227 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SNCBQ16143 134 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 Q6ZR03 302 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 NAA40Q86UY6 237 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR2Z1Q8NG97 314 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 THEM6Q8WUY1 208 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 RAB1CQ92928 201 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 C1orf159Q96HA4 380 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms