RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF786	Q8N393	782 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	EME1	Q96AY2	570 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	HAVCR1	Q96D42	359 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	USE1	Q9NZ43	259 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ABCA1	O95477	2261 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CDC14B	O60729	498 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	NCR1	O76036	304 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-46	P01743	117 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A1	P11166	492 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	HCCS	P53701	268 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CDC42	P60953	191 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR2T2	Q6IF00	324 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	DRAM2	Q6UX65	266 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OTOS	Q8NHW6	89 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	RDH5	Q92781	318 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	AMELY	Q99218	206 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		15.13	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CCDC182	A6NF36	153 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ERICH4	A6NGS2	130 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TBX1	O43435	398 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	KITLG	P21583	273 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	COL8A2	P25067	703 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	NR4A2	P43354	598 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CX3CR1	P49238	355 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	PRSS12	P56730	875 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	PGAP1	Q75T13	922 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GID4	Q8IVV7	300 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TOR3A	Q9H497	397 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	BRD7	Q9NPI1	651 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	DYSF	O75923	2080 aa		15.12	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	LY6G6D	O95868	133 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	APOC1	P02654	83 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TNFSF4	P23510	183 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	EFNB1	P98172	346 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	USP51	Q70EK9	711 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	KRT77	Q7Z794	578 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	DIRC2	Q96SL1	478 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC29A1	Q99808	456 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		15.11	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	HEXA	P06865	529 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SELE	P16581	610 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OPRL1	P41146	370 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	RCN1	Q15293	331 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM209A	Q5JX71	171 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	FAM57B	Q71RH2	274 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	YIPF5	Q969M3	257 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	SP140L	Q9H930	580 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CHODL	Q9H9P2	273 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	TREM2	Q9NZC2	230 aa		15.1	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GGT3P	A6NGU5	568 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	VWC2L	B2RUY7	222 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	PSMD9	O00233	223 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ALOX5AP	P20292	161 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ACHE	P22303	614 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GIF	P27352	417 aa		15.09	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1E1	P36543	226 aa		15.09	■□□□□ 0.01

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