RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433271.6

TMEM248-205, Transcript of transmembrane protein 248, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM248, Length 1,610 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248-205ENST00000433271 CCL2P13500 99 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 HGFACQ04756 655 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 TBC1D28Q2M2D7 210 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 FAM57BQ71RH2 274 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 MS4A15Q8N5U1 240 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 OR1J2Q8NGS2 313 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 TMED9Q9BVK6 235 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 SP140LQ9H930 580 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF281Q9Y2X9 895 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM248-205ENST00000433271 H3BSA7 217 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CLDN14O95500 239 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CCNOP22674 350 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 RPS25P62851 125 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TRAM1Q15629 374 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF676Q8N7Q3 588 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 OR52H1Q8NGJ2 320 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM203Q969S6 136 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 A6NHS1 94 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TTRP02766 147 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TFF3Q07654 80 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 COLCA1Q6ZS62 124 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 PGAM5Q96HS1 289 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 LCATP04180 440 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ISG15P05161 165 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GADD45AP24522 165 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SORDQ00796 357 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 HLA-DPB1P04440 258 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CECR9P0C854 216 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF83P51522 516 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ODF4Q2M2E3 257 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 RDH10Q8IZV5 341 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 STUB1Q9UNE7 303 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ANOS1P23352 680 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CRYBB2P43320 205 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM244Q5VVB8 128 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ABHD4Q8TB40 342 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 MED18Q9BUE0 208 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 OR10A2Q9H208 303 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 OR51E2Q9H255 320 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 CDH20Q9HBT6 801 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 A0A0U1RQV5 110 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 THBDP07204 575 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GALP22466 123 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TMBIM6P55061 237 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 C5orf63A6NC05 138 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TBX1O43435 398 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 AIREO43918 545 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ICMTO60725 284 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SERPINA3P01011 423 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF35P13682 527 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 FABP5Q01469 135 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 FLNCQ14315 2725 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 M0R1B8 84 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GPX5O75715 221 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GABARAPO95166 117 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 WNT5AP41221 380 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM248-205ENST00000433271 OR51E1Q8TCB6 317 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms