RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 MT-ND5P03915 603 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RAC2P15153 192 aa20.34■□□□□ 0.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF81P51508 661 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 APOL3O95236 402 aa20.34■□□□□ 0.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.33■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.33■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM168AQ92567 244 aa20.33■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.33■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 BRD7Q9NPI1 651 aa20.33■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PRR32B1ATL7 298 aa20.32■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 SLC16A6O15403 523 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LYNX1P0DP58 116 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.32■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 KRT77Q7Z794 578 aa20.32■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 LIPAP38571 399 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF92Q03936 586 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC25A30Q5SVS4 291 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 C10orf105Q8TEF2 133 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 TBX5Q99593 518 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CLN6Q9NWW5 311 aa20.31■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 TBX1O43435 398 aa20.3■□□□□ 0.84
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UBE2E3-202ENST00000410062 PDLIM4P50479 330 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CXCR4P61073 352 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 OCLNQ16625 522 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 Q6ZR03 302 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PGAP1Q75T13 922 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LILRA1O75019 489 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CSF3P09919 207 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1E1P36543 226 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC34A1Q06495 639 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 POU4F2Q12837 409 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 TMED1Q13445 227 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CYGBQ8WWM9 190 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8B4Q96RC9 309 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MROQ9BYG7 248 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.29■□□□□ 0.84
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