RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 INTS14Q96SY0 518 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNJ15Q99712 375 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FN3KQ9H479 309 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 NTN4Q9HB63 628 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MSL2Q9HCI7 577 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM100Q9NV29 134 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 AP4S1Q9Y587 144 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DYSFO75923 2080 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GWJ7 208 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LRP5LA4QPB2 252 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TVP23AA6NH52 213 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC30A6NM36 301 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 G3V2T6 193 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 XRCC2O43543 280 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FSTL3O95633 263 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPARCP09486 303 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PRKACGP22612 351 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DDOSTP39656 456 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC6A9P48067 706 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CRISP1P54107 249 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LMO4P61968 165 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MZT1Q08AG7 82 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIP10Q15642 601 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T2Q6IF00 324 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PGAP1Q75T13 922 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF511Q8NB15 262 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51F2Q8NH61 342 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OTULINQ96BN8 352 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 COPS4Q9BT78 406 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NIPAL2Q9H841 368 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR76Q9H967 626 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPMQ9NSP4 180 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.21□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOD1A6NK06 481 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GMDSO60547 372 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TIPRLO75663 272 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GYPBP06028 91 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GATA3P23771 443 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GATA4P43694 442 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RAD23AP54725 363 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MVKQ03426 396 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SNAPC1Q16533 368 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OTPQ5XKR4 325 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZR03 302 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CPOQ8IVL8 374 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPICQ8N5J4 248 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ST7LQ8TDW4 575 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM186Q96B77 213 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2V2Q96R30 315 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 POFUT1Q9H488 388 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RGCCQ9H4X1 137 aa7.2□□□□□ -1.26
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