RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 QPRTQ15274 297 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00523Q86TU6 105 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MICU2Q8IYU8 434 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TOP1MTQ969P6 601 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LZTS2Q9BRK4 669 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ULBP2Q9BZM5 246 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52D1Q9H346 318 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LYRM4Q9HD34 91 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 HRASLS2Q9NWW9 162 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 STK38LQ9Y2H1 464 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 HYOU1Q9Y4L1 999 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GMEB1Q9Y692 573 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SMCO3A2RU48 225 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C74A6NCV1 312 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SMKR1H3BMG3 65 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NVLO15381 856 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2J3O76001 311 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TGM6O95932 706 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSLP07711 333 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC172P0C7W6 258 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB3AP20336 220 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 STOMP27105 288 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CXCL12P48061 93 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 HCAR3P49019 387 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNG1P51959 295 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB11AP62491 216 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PITPNAQ00169 270 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF8Q02556 426 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ITIH4Q14624 930 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB11BQ15907 218 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 Q3ZCU0 254 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF488Q96MN9 340 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP2AO43633 222 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST1O43916 411 aa2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR8U9P0C7N5 309 aa2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 GSTM3P21266 225 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC1A1P43005 524 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 P2RX1P51575 399 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN2DP55273 166 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ILKQ13418 452 aa2.01□□□□□ -2.09
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