RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 GNRHR2Q96P88 292 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 POFUT1Q9H488 388 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RNF167Q9H6Y7 350 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NLRC3Q7RTR2 1065 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HES7Q9BYE0 225 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 WDR1O75083 606 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SNAPINO95295 136 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RFX2P48378 723 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SLC25A26Q70HW3 274 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR2G2Q8NGZ5 317 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF225Q9UK10 706 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RAB13P51153 203 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 QPCTLQ9NXS2 382 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 GPR12P47775 334 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 AQP6Q13520 282 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 AMER3Q8N944 861 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.27■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 USP54Q70EL1 1684 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 MEOX1P50221 254 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 FXNQ16595 210 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 OR1J1Q8NGS3 322 aa18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 A0A0B4J2E0 115 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 A0A1B0GX12 115 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 DFFBO76075 338 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 S1PR3Q99500 378 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 NME2P22392 152 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 LYSMD2Q8IV50 215 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 OPA3Q9H6K4 179 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 A4GNTQ9UNA3 340 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 IFITM5A6NNB3 132 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 CDAP32320 146 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 RAC1P63000 192 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ZNF626Q68DY1 528 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 MMP25Q9NPA2 562 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SLC23A1Q9UHI7 598 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 CD160O95971 181 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 FABP1P07148 127 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 OPRM1P35372 400 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 GNB2P62879 340 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SSX4O60224 188 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 KIAA0040Q15053 153 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SMIM15Q7Z3B0 74 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 KIAA1456Q9P272 454 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 BCORQ6W2J9 1755 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 F6UZH7 168 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 LGALS8O00214 317 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ST8SIA3O43173 380 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 RAB1AP62820 205 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 KCNIP4Q6PIL6 250 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 LINC00299Q6ZSB3 139 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SUCNR1Q9BXA5 334 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 PLK3Q9H4B4 646 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 PPT1P50897 306 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SCGB2A2Q13296 93 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 CNR1P21554 472 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 NKG7Q16617 165 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 GSG1Q2KHT4 349 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 ARV1Q9H2C2 271 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SMCHD1A6NHR9 2005 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 FAM221AA4D161 298 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 SMIM18P0DKX4 95 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-202ENST00000285681 PPP1CAP62136 330 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms