RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 ACHEP22303 614 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 CAMK2DQ13557 499 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 IFI44Q8TCB0 444 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SLC6A7Q99884 636 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 A0A0G2JK05 382 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 IFNA10P01566 189 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 IFNA4P05014 189 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 CXCL3P19876 107 aa14.62□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 MFRPQ9BY79 579 aa14.62□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 R4GMQ9 66 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ALPK3Q96L96 1907 aa14.62□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.61□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.61□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 P2RY10O00398 339 aa14.61□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.6□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 IFNA17P01571 189 aa14.6□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RRASP10301 218 aa14.6□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.6□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 SCAND1P57086 179 aa14.6□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SLC35A1P78382 337 aa14.6□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RSU1Q15404 277 aa14.6□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 CLPSP04118 112 aa14.6□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 PNLIPP16233 465 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 AKR1C4P17516 323 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 TAS2R19P59542 299 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RAP2BP61225 183 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.59□□□□□ -0.07
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