RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GmfgQ9ERL7 142 aa9.6□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smurf2A2A5Z6 748 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13078A2AGW8 474 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esp22A8R0V4 111 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21789J3QMZ1 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21870J3QPN2 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21883J3QPV3 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15292L7N231 93 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7138L7N2C3 230 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtn2O70622 471 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stc2O88452 296 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01725 110 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GzmgP13366 248 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec10aP49300 304 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efna1P52793 205 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bglap3P54615 95 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl27P61358 136 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defa26Q3L180 93 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf3Q60980 344 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tssk1bQ61241 365 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr94Q6UAH0 386 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsh2dQ6VYH9 334 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp429Q7M6Y0 485 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Teddm1aQ810U2 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a6Q8BGK6 515 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pomt2Q8BGQ4 820 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 StgQ8BM15 349 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmco6Q8BQX5 494 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ncr1Q8C567 325 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gykl1Q8C635 549 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prokr2Q8K458 381 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myct1Q8R411 188 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NagsQ8R4H7 527 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptgr2Q8VDQ1 351 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhgb2Q91XX7 928 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp22Q99N11 184 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnase6Q9D244 153 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fndc8Q9D2H8 321 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlgrktQ9D3P8 147 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam162aQ9D6U8 155 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp111Q9R164 701 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb3Q9WTL0 63 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3238W4VSP7 230 aa9.59□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xirp2Q4U4S6 3784 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm38303A0A0A6YWW8 100 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp493E9Q1L8 384 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A530032D15RikE9Q422 215 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr370E9Q848 314 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc74aE9Q9U8 364 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf10O89091 479 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbc1d10aP58802 500 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NfycP70353 335 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crisp1Q03401 244 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acp5Q05117 327 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SryQ05738 395 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NmsQ5H8A1 153 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mylk4Q5SUV5 386 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acvr1bQ61271 505 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd47Q61735 303 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1282Q7TQY5 305 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp819Q80V81 607 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elmod2Q8BGF6 293 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Palm2Q8BR92 376 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb37Q8C3U9 504 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spink10Q8CAC8 162 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApehQ8R146 732 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mboat2Q8R3I2 519 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr354Q8VGJ8 317 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnaja3Q99M87 480 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tktl1Q99MX0 595 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Toe1Q9D2E2 511 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx12Q9ER00 274 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GrinaQ9ESF4 345 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ropn1Q9ESG2 212 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fzr1Q9R1K5 493 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dgat1Q9Z2A7 498 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F5O88783 2183 aa9.58□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv13-84A0A140T8N3 115 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd8D3YUB6 377 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r103K7N6X7 305 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r122K7N726 305 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r151L7N288 305 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 E2f6O54917 272 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SgceO70258 437 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmd3P14685 530 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lyl1P27792 278 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab8aP55258 207 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps23P62267 143 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Milr1Q3TB92 246 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AgerQ62151 402 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AgaQ64191 346 aa9.57□□□□□ -0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Egfl8Q6GUQ1 293 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.6 ms