RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 ARMCX1Q9P291 453 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV40A0A0B4J280 105 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 TXNDC12O95881 172 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 PMELP40967 661 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 OMPP47874 163 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 FXYD6P3P58550 94 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 OR8B2Q96RD0 313 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 MEP1BQ16820 701 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.8■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.8■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 SASH3O75995 380 aa20.77■□□□□ 0.92
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PTPRF-216ENST00000617451 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.76■□□□□ 0.91
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PTPRF-216ENST00000617451 ERGIC1Q969X5 290 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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