RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 COX7A2P2O60397 106 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GABRB1P18505 474 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PI4KAP42356 2102 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TEX29Q8N6K0 151 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HTR6P50406 440 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IL17FQ96PD4 163 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MMP26Q9NRE1 261 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 BTAF1O14981 1849 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP6Q13023 2319 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRLHRP49683 370 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC14AQ86T13 490 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF429Q86V71 674 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LAMTOR5O43504 91 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 F3P13726 295 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HOXC13P31276 330 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PIGAP37287 484 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF4P43489 277 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 XCR1P46094 333 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C21orf58P58505 322 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TEAD3Q99594 435 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SELENOFO60613 162 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR5G3P0C626 314 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FABP2P12104 132 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FAM3CQ92520 227 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PATJQ8NI35 1801 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ACOD1A6NK06 481 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 H3BML4 177 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BMPR1BO00238 502 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BMPR1AP36894 532 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AS1Q8N127 324 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BCL2L11O43521 198 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FGF18O76093 207 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK1DP48730 415 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 IL10RAQ13651 578 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CST6Q15828 149 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TAZQ16635 292 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PIGCQ92535 297 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LIPAP38571 399 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR51F2Q8NH61 342 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQU0 124 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NTF3P20783 257 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SHC1P29353 583 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PGGT1BP53609 377 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EGR3Q06889 387 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AQP6Q13520 282 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 THEM4Q5T1C6 240 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DOK3Q7L591 496 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MED20Q9H944 212 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OPN1MWP04001 364 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CEBPBP17676 345 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR1D4P47884 311 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR2B8PP59922 312 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms