RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ORAI1Q96D31 301 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF75AQ96N20 296 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf198Q9H425 327 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ATMQ13315 3056 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HCFC1P51610 2035 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WXM4 84 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NIN4 97 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL15A6NJ78 407 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SNTNA6NMZ2 147 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf97H3BN30 126 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZZEF1O43149 2961 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX1O43435 398 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNGR3O43761 229 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN14O95500 239 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PLAUP00749 431 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NGFP01138 241 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TFAP2AP05549 437 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT8P05787 483 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CECR9P0C854 216 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DCKP27707 260 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CALCRP30988 508 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TGFBR1P36897 503 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LIPAP38571 399 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OPRL1P41146 370 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT5AP41221 380 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A9P48067 706 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CX3CR1P49238 355 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 BLVRAP53004 296 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT4P56705 351 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CSNK2BP67870 215 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTC1P68032 377 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTA1P68133 377 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TFF3Q07654 80 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC3A1Q07837 685 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RY6Q15077 328 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PPA1Q15181 289 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB35Q15286 201 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX1Q16384 188 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC36A2Q495M3 483 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR38Q5JTN6 314 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX30Q5JUR7 227 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LIPNQ5VXI9 398 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF627Q7L945 461 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2AE1Q8NHA4 323 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RORBQ92753 470 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NEUROG1Q92886 237 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM203Q969S6 136 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MUL1Q969V5 352 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OPALINQ96PE5 141 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF6BQ99941 703 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 JAM3Q9BX67 310 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FZR1Q9UM11 496 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.22□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ESPL1Q14674 2120 aa5.21□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ITPR1Q14643 2758 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPK0 400 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 IRGMA1A4Y4 181 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM30A4D0T7 59 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf49A4QMS7 147 aa5.21□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6C6A6NF89 314 aa5.21□□□□□ -1.58
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