RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF774Q6NX45 483 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ELMOD2Q8IZ81 293 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf78Q8N4C9 275 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 FGFBP3Q8TAT2 258 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 POLEQ07864 2286 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 RTTNQ86VV8 2226 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKXP51817 358 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TPTEP56180 551 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM244Q5VVB8 128 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 DRAM2Q6UX65 266 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 NDNFQ8TB73 568 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR148Q8TDV2 347 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SP140LQ9H930 580 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R135 149 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CA7P43166 264 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GALK2Q01415 458 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF799Q96GE5 643 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRTA2Q96SC8 542 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PBOV1Q9GZY1 135 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC17A5Q9NRA2 495 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPR1Q14643 2758 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JNJ9 132 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL6IP5O75915 188 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PATE4P0C8F1 98 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR5AP47898 357 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB10P48595 397 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB1AP62820 205 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PLP2Q04941 152 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 Q499Y3 187 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMAT1Q5H9K5 638 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM19Q7Z692 300 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR7LQ8NHP1 331 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 MED18Q9BUE0 208 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF167Q9H6Y7 350 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 OBP2BQ9NPH6 170 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNT2Q9NY97 397 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 Q9UFV3 132 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A13Q9Y226 551 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 LYZL6O75951 148 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-HP01893 362 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CD79AP11912 226 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ACHEP22303 614 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK6P29122 969 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC12P31275 282 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ST3GAL2Q16842 350 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 GSG1Q2KHT4 349 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 HIKESHIQ53FT3 197 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRGQ86SM5 289 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF879B4DU55 563 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H5K5 113 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD51DO75771 328 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1AP01583 271 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 SFRP5Q5T4F7 317 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS45Q7RTY3 260 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 RND1Q92730 232 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 HHLA2Q9UM44 414 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MEMO1Q9Y316 297 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DVL2O14641 736 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TTRP02766 147 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 RAF1P04049 648 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 UCHL1P09936 223 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX7P23759 505 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFBR1P36897 503 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52H1Q8NGJ2 320 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C5Q8NGS8 318 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 OCM2P0CE71 109 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DGUOKQ16854 277 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14A2Q96R54 314 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 BRD7Q9NPI1 651 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSM4P0C7M7 580 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A9P48067 706 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MTNR1BP49286 362 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 INSL4Q14641 139 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO7BQ6PIF6 2116 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0U1RQV5 110 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MXE2 369 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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