RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ACOD1A6NK06 481 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SLC17A2O00624 439 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SSX4O60224 188 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SUSD5O60279 629 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 FADS1O60427 444 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SELENOFO60613 162 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ADAM11O75078 769 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ICOSLGO75144 302 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 GYPBP06028 91 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 IFNGR1P15260 489 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ZNF823P16415 610 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 ACHEP22303 614 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 OR10A3P58181 314 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 PPP1CAP62136 330 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 EGR4Q05215 589 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 FGL1Q08830 312 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 MEF2DQ14814 521 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 CD226Q15762 336 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 RAB11BQ15907 218 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 PCK2Q16822 640 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 GSG1Q2KHT4 349 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 MESTQ5EB52 335 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SIAH3Q8IW03 269 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 OR52N5Q8NH56 324 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ZNF519Q8TB69 540 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.16□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 GGT3PA6NGU5 568 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 H7C417 338 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 TP53I11O14683 189 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 DNPH1O43598 174 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 TOXO94900 526 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 NDUFB6O95139 128 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DQA2P01906 255 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 LPLP06858 475 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 CD37P11049 281 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 GIFP27352 417 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 MMP16P51512 607 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGA3-218ENST00000584243 GFERP55789 205 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R19P59542 299 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 RNF4P78317 190 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 IFITM2Q01629 132 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 IL11RAQ14626 422 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SLC17A1Q14916 467 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 26.4
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GGA3-218ENST00000584243 ACKR1Q16570 336 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 MIDNQ504T8 468 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 THEM4Q5T1C6 240 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 RTL6Q6ICC9 239 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-218ENST00000584243 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.15□□□□□ -1.26
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