RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAMP3	O60896	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	VAPB	O95292	243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNA5	P01569	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PET100	P0DJ07	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	EFNA3	P52797	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAS2R39	P59534	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q8N402	240 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDS1	Q92903	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BAD	Q92934	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCRG1	O75711	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2F2	O95006	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINA1	P01009	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPI1	P17947	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCL3	P20749	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SDC4	P31431	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KDELR2	P33947	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	P2RY1	P47900	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPBWR2	P48146	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	UCN	P55089	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SEC61G	P60059	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBX1	P62877	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB31	Q13636	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ITIH4	Q14624	930 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GV90	55 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms