RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 PGGHGQ32M88 737 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MMEL1Q495T6 779 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 BEX5Q5H9J7 111 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CASP12Q6UXS9 341 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF100Q8IYN0 542 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RNF148Q8N7C7 305 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM54Q969K7 222 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM68Q96MH6 324 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 OXGR1Q96P68 337 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 GPA33Q99795 319 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM107BQ9H098 131 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FKRPQ9H9S5 495 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 NOX3Q9HBY0 568 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SLC17A5Q9NRA2 495 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MED29Q9NX70 200 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 B3GNT2Q9NY97 397 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RTTNQ86VV8 2226 aa4.1□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MED13LQ71F56 2210 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 A0A087WUU8 490 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1W2PR80 420 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ENO4A6NNW6 628 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 E7EQL1 145 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CDC42EP2O14613 210 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 HS3ST1O14792 307 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 PTP4A3O75365 173 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RAD51DO75771 328 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 OR7A10O76100 309 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MT-ATP6P00846 226 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 SERPINA1P01009 418 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MT-ND1P03886 318 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RAF1P04049 648 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ALPLP05186 524 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 PRSS2P07478 247 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ATP6V1B2P21281 511 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CBLP22681 906 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 IL32P24001 234 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ART1P52961 327 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 F2RL1P55085 397 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 CLDN17P56750 224 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 VLDLRP98155 873 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MS4A2Q01362 244 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 PUDPQ08623 228 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 PPA1Q15181 289 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MED22Q15528 200 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM225Q6GV28 225 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 AAED1Q7RTV5 226 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.09□□□□□ -1.75
PRPF8-211ENST00000574728 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms