RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.16□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 A0A1B0GWJ7 208 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 DBX1A6NMT0 343 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 LEUTXA8MZ59 168 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PPIAL4DF5H284 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 H0YAE9 185 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 DHHO43323 396 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 CLN5O75503 358 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 IGHV3-13P01766 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 IGHV2-5P01817 119 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 ADH4P08319 380 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 TSPAN19P0C672 248 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PSKH1P11801 424 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 EPHA1P21709 976 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 CBLP22681 906 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 GATA3P23771 443 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 MAGEB1P43366 347 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 RAD23AP54725 363 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 BIDP55957 195 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 RBBP4Q09028 425 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 C10orf128Q5T292 105 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 ZNF519Q8TB69 540 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 ZNF566Q969W8 418 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 JMJD8Q96S16 334 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 ZNF607Q96SK3 696 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 MMP27Q9H306 513 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 GPR160Q9UJ42 338 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
PALB2-202ENST00000561514 A0A0G2JMP0 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 A0A0X1KG70 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMEM82A0PJX8 343 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CTDSP2O14595 271 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PTHP01270 115 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IFNA4P05014 189 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PATE4P0C8F1 98 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ADORA3P0DMS8 318 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CD247P20963 164 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC6A2P23975 617 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RAB13P51153 203 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PRKCDQ05655 676 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SPATS1Q496A3 300 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 KLHL12Q53G59 568 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PRR31Q5SQ13 230 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RRM2BQ7LG56 351 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DPP10Q8N608 796 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 POC5Q8NA72 575 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LIPHQ8WWY8 451 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RAB39BQ96DA2 213 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MCHR1Q99705 422 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CCDC32Q9BV29 185 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OPN4Q9UHM6 478 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DUSP13Q9UII6 198 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FZR1Q9UM11 496 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.14□□□□□ -1.27
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