RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MMP27	Q9H306	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		R4GMQ9	66 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DMD	P11532	3685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GVI7	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		E9PI62	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TAF4	O00268	1085 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SGCE	O43556	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CLPX	O76031	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LALBA	P00709	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CRH	P06850	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	INHBB	P09529	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OCM2	P0CE71	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF12	P17014	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ARR3	P36575	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MTNR1B	P49286	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PSMD7	P51665	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CASP6	P55212	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TPTE	P56180	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FABP5	Q01469	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLP2	Q04941	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MXD1	Q05195	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FAP	Q12884	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	KLRB1	Q12918	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RAB35	Q15286	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		Q499Y3	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ATF6B	Q99941	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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