RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	IL18R1	Q13478	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	GABRA6	Q16445	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	VCX	Q9H320	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	MED29	Q9NX70	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB5B-209	ENST00000551459	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459		A6NNC1	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CASK	O14936	926 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TXNL1	O43396	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	UPK3A	O75631	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	UBL3	O95164	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PTH	P01270	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF3	P17036	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FST	P19883	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TUBG1	P23258	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LAP3	P28838	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ARR3	P36575	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ERF	P50548	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF134	P52741	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MFAP4	P55083	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ERVK-25	P63136	954 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SIRPA	P78324	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FHL3	Q13643	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KEAP1	Q14145	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GINS1	Q14691	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RCN1	Q15293	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MEST	Q5EB52	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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