RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SPACA5Q96QH8 159 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 FOXB1Q99853 325 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PROB1E7EW31 1015 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 AIPO00170 330 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PTHLHP12272 177 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SPNP16150 400 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ABOP16442 354 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 CCNOP22674 350 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TRIQKQ629K1 86 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 FDX2Q6P4F2 183 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 KRT74Q7RTS7 529 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.41□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ABHD1Q96SE0 405 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 CCDC32Q9BV29 185 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 HSPB2A8KAH6 182 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 E9PLN8 166 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SLC19A2O60779 497 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 PLA2G7Q13093 441 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 HSPB2Q16082 182 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 C10orf128Q5T292 105 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF774Q6NX45 483 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SCMH1Q96GD3 660 aa7.41□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.41□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GVI7 797 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 K7EM74 188 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 APOA1P02647 267 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF32P17041 273 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NPR2P20594 1047 aa7.4□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.4□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 PGAM5Q96HS1 289 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GPR35Q9HC97 309 aa7.4□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 SPATA2Q9UM82 520 aa7.4□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 FAM27BQ5VT28 67 aa7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 OR10K2Q6IF99 312 aa7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.4□□□□□ -1.23
CS-215ENST00000549143 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.4□□□□□ -1.23
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