RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	NUDT9	Q9BW91	350 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	REG4	Q9BYZ8	158 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CPED1	A4D0V7	1026 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDC20B	Q86Y33	519 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A0G2JNG1	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T1	O43869	369 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR2DS5	Q14953	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TSLP	Q969D9	159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	VSTM2L	Q96N03	204 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MED29	Q9NX70	200 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADAP1	O75689	374 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CTLA4	P16410	223 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	RGS19	P49795	217 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TSC22D1	Q15714	1073 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEBPE	Q15744	281 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	STPG1	Q5TH74	334 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	PGAM5	Q96HS1	289 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705		K7EPK0	472 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SULT1C2	O00338	296 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SERPINA2	P20848	420 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIR3DL2	P43630	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FMOD	Q06828	376 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	EMC4	Q5J8M3	183 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC25A28	Q96A46	364 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705		F5H5K5	113 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CTSB	P07858	339 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF141	Q15928	474 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	NUBPL	Q8TB37	319 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM127	O75204	238 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	NFYB	P25208	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR52N5	Q8NH56	324 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRIM77	I1YAP6	450 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	LRP3	O75074	770 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	WRB	O00258	174 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABCD4	O14678	606 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	GABRR1	P24046	479 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	MPG	P29372	298 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2B8P	P59922	312 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR85	P60893	370 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FHL5	Q5TD97	284 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF128	Q8TEB7	428 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYPD3	O95274	346 aa		12.47	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms