RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMA5O15230 3695 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RER1O15258 196 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ORC5O43913 435 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 LMX1BO60663 402 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGA5P08648 1049 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MSR1P21757 451 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL1P22362 96 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK2P24941 298 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CD82P27701 267 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 NTF4P34130 210 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 STARP49675 285 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SELENOPP49908 381 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX8P57073 446 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TOMM20Q15388 145 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB11BQ15907 218 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC7A6Q92536 515 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 UPRTQ96BW1 309 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SFXN2Q96NB2 322 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RCE1Q9Y256 329 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 APC2O95996 2303 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CIB4A0PJX0 185 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 XRCC3O43542 346 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCL13O43927 109 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 DOK2O60496 412 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CYTIPO60759 359 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC6AO75865 159 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNKO75909 580 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QL1O75973 258 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 WDPCPO95876 746 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 F10P00742 488 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV3-1P01715 115 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD11B1P28845 292 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 GDNFP39905 211 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CASRP41180 1078 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 POU3F4P49335 361 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 EFNB2P52799 333 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R20P59543 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RTP5Q14D33 572 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1C1Q15619 314 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SGCAQ16586 387 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM27BQ5VT28 67 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZSR3 168 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 SULF2Q8IWU5 870 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MDS2Q8NDY4 140 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52I2Q8NH67 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10D3Q8NH80 312 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 NELFAQ9H3P2 528 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ABI3Q9P2A4 366 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CKLFQ9UBR5 152 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 CTAG2O75638 210 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT33AO76009 404 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ANOS1P23352 680 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGA3P26006 1051 aa9.5□□□□□ -0.89
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