RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	DSN1	Q9H410	356 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1B0GWA3	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1B0GX78	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BHLHE40	O14503	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	YKT6	O15498	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CLPX	O76031	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GLCE	O94923	617 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB36	O95755	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IGF2	P01344	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HMGN1	P05114	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FOLR1	P15328	257 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GNS	P15586	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PAX1	P15863	534 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TBXA2R	P21731	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PPIC	P45877	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR4	P46093	362 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CDH11	P55287	796 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NCS1	P62166	190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB40B	Q12829	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ART5	Q96L15	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PTPRB	P23467	1997 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A087WUJ7	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PQD3	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		J3QRE1	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms