RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 XKR6Q5GH73 641 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM225Q6GV28 225 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZVU0 165 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 NIT1Q86X76 327 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 Q8WTZ3 238 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 VWCEQ96DN2 955 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SFRP2Q96HF1 295 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SNX22Q96L94 193 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 EVPLQ92817 2033 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 PTPRSQ13332 1948 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 PLXNA3P51805 1871 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 A6NIN4 97 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CD8B2A6NJW9 211 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 M0R129 80 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF208O43345 1280 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFB8O95169 186 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 F11P03951 625 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CELP19835 753 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 FCARP24071 287 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 NMBRP28336 390 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 IL12BP29460 328 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC6A8P48029 635 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 AGTR2P50052 363 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SULT1A2P50226 295 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB9AP51151 201 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CKS1BP61024 79 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 BTN3A2P78410 334 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 NFATC2Q13469 925 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 TTLL4Q14679 1199 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 TCTN1Q2MV58 587 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf73Q69YU5 71 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNT16Q8N428 558 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52J3Q8NH60 311 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 PPCDCQ96CD2 204 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 IL17FQ96PD4 163 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 PLK3Q9H4B4 646 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR35Q9HC97 309 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CNIH4Q9P003 139 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SCML2Q9UQR0 700 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 STYXL1Q9Y6J8 313 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SIP14410 1827 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN5AQ14524 2016 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 TISP43B9A030 160 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 XKRYO14609 159 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CSN2P05814 226 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP2P08253 660 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CT45A8P0DMV1 189 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CT45A9P0DMV2 189 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 OR13C7P0DN81 318 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 DRD1P21728 446 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CXCR1P25024 350 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 S100GP29377 79 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 S100A3P33764 101 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 GLIPR1P48060 266 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 HMGA2P52926 109 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CDK3Q00526 305 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 ID2Q02363 134 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 ST3GAL3Q11203 375 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 TCF15Q12870 199 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 CTBP1Q13363 440 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-208ENST00000471759 AGERQ15109 404 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms